De plannen van de Tweede Kamer om te onderzoeken of nieuw land kan worden gewonnen in het Markermeer, stuiten op kritiek van Natuurmonumenten. De organisatie ziet niets in een nieuwe stad in het beschermde natuurgebied. Het Markermeer heeft een status als Natura 2000-gebied en is belangrijk voor vogels, vissen en planten. Ook heeft het meer een functie als zoetwaterbuffer voor Nederland. Een meerderheid in de Kamer wil laten onderzoeken of landaanwinning in het Markermeer ruimte kan bieden voor woningbouw voor tienduizenden mensen. Natuurmonumenten is op dit moment nog niet betrokken te zijn bij het haalbaarheidsonderzoek waar de Tweede Kamer om vraagt, maar verwacht wel aan tafel te komen zitten als plannen verder worden uitgewerkt.

Natuurmonumenten was nauw betrokken bij de aanleg van de Marker Wadden tussen 2016 en 2021. Dat is echter louter gebeurd om de natuur in het Markermeer te herstellen. De kunstmatige eilanden, nabij Lelystad, moeten de biodiversiteit versterken en bieden leefruimte aan talloze soorten dieren en planten. In de Tweede Kamer werd ook gesproken over uitbreiding van de Marker Wadden, maar het is volgens Natuurmonumenten niet vanzelfsprekend dat woningbouw en natuurontwikkeling hand in hand gaan. Als er een stad in het Markermeer wordt gebouwd heeft dat volgens Natuurmonumenten gevolgen voor het hele ecosysteem. De impact beperkt zich niet tot alleen de plek waar gebouwd wordt. Uitbreiding van de Marker Wadden moet los worden gezien van plannen voor stedelijke ontwikkeling, vindt de organisatie.